Le vice-amiral Muselier a quitté Marseille pour Gibraltar le 23 juin 1940 sur le Cydonia, un charbonnier anglais.
A son arrivée en Angleterre, il est le premier officier général à rallier spontanément le général de Gaulle.
Le 1er juillet 1940, rencontre avec le général de Gaulle. Ce jour là il lui proposera : "pour nos bateaux et notre personnel le port d'un signe distinctif : une croix de Lorraine, face à la croix gammée." Le même jour l'Amiral Muselier est nommé au commandement des forces navales et aériennes françaises libres.